280、320、230、260nm下的吸光度分別代表了核酸、背景(溶液渾濁度)、鹽濃度和蛋白等有機物的值。 A230 測定其它碳源物質(zhì),如酚,糖類等; A260 是核酸的吸收峰測 RNA 和 DNA,引物等的濃度用的; A280 是蛋白質(zhì)的吸收峰。 一般的,我們只看 OD260/OD280(Ratio,R)——1.8~2.0時,我們認為RNA中蛋白或者時其他有機物的污染是可以容忍的,不過要注意,當用 Tris 作為緩沖液檢測吸光度時,R 值可能會大于2(一般應(yīng)該是<2.2的)。當 R<1.8時,溶液中蛋白或者其他有機物的污染比較明顯,你可以根據(jù)自己的需要決定這份RNA的命運。當 R>2.2時,說明 RNA 已經(jīng)水解成單核酸了。 純RNA 的A260/A280的比值為 2.0。 OD260/OD230的比值還表明 RNA 的純度——其值 <2.0 表明裂解液中有亞硫氰胍和β-巰基乙醇殘留,其值>2.4,需用乙酸鹽,乙醇沉淀 RNA。 附: 260/230的值,一般不要小于2.0,小的話表明有異硫氰酸胍,β-巰基乙醇或乙醇的殘留。補救的方法是再沉淀一次,然后重復(fù)乙醇洗滌的過程。但從我的經(jīng)驗看,后面RNA丟得很多……因此提RNA時就注意了 個人經(jīng)驗,260/230偏小的話,提取時可以改進以下幾點: 1.加氯仿抽提后取少一點上清,不要貪多。 2.加乙醇洗的時候,多晃幾次,盡量讓RNA沉淀整片懸浮起來(有時候確實浮不起來也沒辦法。) 3.棄乙醇的時候,用槍吸而不是傾倒,倒的話經(jīng)常有液滴留在管壁上,倒不干凈。第一次用藍槍頭吸,可以不完全吸干,免得吸到沉淀;然后短暫離心把殘余酒精甩到管底,看準了用白槍頭盡量吸干凈。RNA量大,被白槍頭弄掉一點也沒關(guān)系。 4.溶解前晾干的時間可以長一點,5分鐘也沒關(guān)系的。標準的做法說是不能晾太久,等沉淀開始變透明就要加水溶解,但是我晾過10分鐘的,后面RNA量也很大??赡芰看螅m然有些溶解不了,最后濃度還是高。 可能不完全正確,但是以前我出現(xiàn)過260/230偏小的問題,按上面方法改進了操作,后面就好了。 還有一種原因可能是多糖類雜質(zhì)殘留,可試試用LiCl沉淀。 RNA溶液的 |
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